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- Sort RUN_DEPENDS and MAN3 Changes: http://search.cpan.org/dist/Bio-MAGETAB/Changes
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b0ea119ac6
Notes:
svn2git
2021-03-31 03:12:20 +00:00
svn path=/head/; revision=277634
@ -6,7 +6,7 @@
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#
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PORTNAME= Bio-MAGETAB
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PORTVERSION= 1.13
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PORTVERSION= 1.20
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CATEGORIES= biology perl5
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MASTER_SITES= CPAN
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PKGNAMEPREFIX= p5-
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@ -14,83 +14,81 @@ PKGNAMEPREFIX= p5-
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MAINTAINER= perl@FreeBSD.org
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COMMENT= A data model and utility API for the MAGE-TAB format
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BUILD_DEPENDS= p5-DateTime-Format-DateManip>=0.04:${PORTSDIR}/devel/p5-DateTime-Format-DateManip \
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RUN_DEPENDS= p5-Date-Manip>=5.44:${PORTSDIR}/devel/p5-Date-Manip \
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||||
p5-DateTime>=0.43.02:${PORTSDIR}/devel/p5-DateTime \
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||||
p5-DateTime-Format-DateManip>=0.04:${PORTSDIR}/devel/p5-DateTime-Format-DateManip \
|
||||
p5-Email-Valid>=0.179:${PORTSDIR}/mail/p5-Email-Valid \
|
||||
p5-Moose>=0.43:${PORTSDIR}/devel/p5-Moose \
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||||
p5-MooseX-FollowPBP>=0.04:${PORTSDIR}/devel/p5-MooseX-FollowPBP \
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||||
p5-MooseX-Types>=0.10:${PORTSDIR}/devel/p5-MooseX-Types \
|
||||
p5-Parse-RecDescent>=1.96:${PORTSDIR}/devel/p5-Parse-RecDescent \
|
||||
p5-Params-Coerce>=0.14:${PORTSDIR}/devel/p5-Params-Coerce \
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||||
p5-URI>=1.35:${PORTSDIR}/net/p5-URI \
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||||
p5-Test-Exception>=0.26:${PORTSDIR}/devel/p5-Test-Exception \
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||||
p5-Date-Manip>=5.44:${PORTSDIR}/devel/p5-Date-Manip \
|
||||
p5-DateTime>=0.43:${PORTSDIR}/devel/p5-DateTime \
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||||
p5-Parse-RecDescent>=1.960:${PORTSDIR}/devel/p5-Parse-RecDescent \
|
||||
p5-Text-CSV_XS>=0.32:${PORTSDIR}/textproc/p5-Text-CSV_XS \
|
||||
p5-Email-Valid>=0.179:${PORTSDIR}/mail/p5-Email-Valid \
|
||||
p5-Moose>=0.43:${PORTSDIR}/devel/p5-Moose
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||||
RUN_DEPENDS= ${BUILD_DEPENDS}
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||||
p5-URI>=1.35:${PORTSDIR}/net/p5-URI
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||||
TEST_DEPENDS= p5-Test-Exception>=0.26:${PORTSDIR}/devel/p5-Test-Exception
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||||
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||||
PERL_CONFIGURE= YES
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||||
PERL_CONFIGURE= yes
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||||
WRKSRC= ${WRKDIR}/${PORTNAME}-${PORTVERSION:C/0$//}
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||||
MAN3= Bio::MAGETAB::Material.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Types.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ControlledTerm.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::DataMatrix.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DesignElement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Contact.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Investigation.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Comment.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Sample.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Publication.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataFile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Event.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Edge.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ArrayDesign.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::ADF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::MatrixColumn.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Normalization.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::TagValueFile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ParameterValue.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::Tabfile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::Tabfile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataAcquisition.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Assay.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::SDRFRow.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::IDF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::MatrixRow.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Data.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Extract.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::IDF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::TermSource.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Measurement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Builder.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::CompositeElement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Node.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::DBLoader.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::BaseClass.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Protocol.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Reporter.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::ADF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Factor.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DatabaseEntry.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Feature.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::LabeledExtract.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ProtocolApplication.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::RewriteAE.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Source.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Persistence.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::GraphViz.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataMatrix.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::FactorValue.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ProtocolParameter.3
|
||||
MAN3= Bio::MAGETAB.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ArrayDesign.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Assay.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::BaseClass.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Comment.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::CompositeElement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Contact.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ControlledTerm.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Data.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataAcquisition.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataFile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DataMatrix.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DatabaseEntry.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::DesignElement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Edge.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Event.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Extract.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Factor.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::FactorValue.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Feature.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Investigation.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::LabeledExtract.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Material.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::MatrixColumn.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::MatrixRow.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Measurement.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Node.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Normalization.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ParameterValue.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Protocol.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ProtocolApplication.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::ProtocolParameter.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Publication.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Reporter.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::SDRFRow.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Sample.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Source.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::TermSource.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Types.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Builder.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::DBLoader.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Persistence.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::ADF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::DataMatrix.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::IDF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::Tabfile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Reader::TagValueFile.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::RewriteAE.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::ADF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::GraphViz.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::IDF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::SDRF.3 \
|
||||
Bio::MAGETAB::Util::Writer::Tabfile.3
|
||||
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||||
post-extract:
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||||
@${REINPLACE_CMD} -e 's?auto_install?#auto_install?g' \
|
||||
${WRKSRC}/Makefile.PL
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||||
post-patch:
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||||
@${REINPLACE_CMD} -e '/^auto_install;/d' ${WRKSRC}/Makefile.PL
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||||
|
||||
.include <bsd.port.mk>
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@ -1,2 +1,2 @@
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||||
SHA256 (Bio-MAGETAB-1.13.tar.gz) = e03547cb58d6d5ef4d76da74856d6dfec215603e0000f044297b657653ef1a74
|
||||
SIZE (Bio-MAGETAB-1.13.tar.gz) = 246449
|
||||
SHA256 (Bio-MAGETAB-1.20.tar.gz) = eef68da1de40b50dab807cf87182fffefc74f5c84ea7eb513229fcd8f5103313
|
||||
SIZE (Bio-MAGETAB-1.20.tar.gz) = 252789
|
||||
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