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Makefile
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Makefile
# New ports collection makefile for: Bio-Phylo
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# Date created: 12 Mar 2006
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# Whom: Aaron Dalton <aaron@FreeBSD.org>
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#
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# $FreeBSD$
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#
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PORTNAME= Bio-Phylo
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PORTVERSION= 0.34
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CATEGORIES= biology perl5
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MASTER_SITES= CPAN
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PKGNAMEPREFIX= p5-
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MAINTAINER= perl@FreeBSD.org
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COMMENT= Phylogenetic analysis using perl
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RUN_DEPENDS= p5-Math-CDF>=0:${PORTSDIR}/math/p5-Math-CDF \
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p5-Math-Random>=0.67:${PORTSDIR}/math/p5-Math-Random \
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p5-SVG>=1.07:${PORTSDIR}/textproc/p5-SVG \
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p5-SWF-Builder>=0:${PORTSDIR}/graphics/p5-SWF-Builder \
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p5-XML-Twig>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-XML-Twig \
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p5-bioperl>=0:${PORTSDIR}/biology/p5-bioperl \
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p5-libxml>=0:${PORTSDIR}/textproc/p5-libxml
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PERL_CONFIGURE= yes
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MAN3= Bio::Phylo.3 \
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Bio::Phylo::EvolutionaryModels.3 \
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Bio::Phylo::Factory.3 \
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Bio::Phylo::Forest::DrawNode.3 \
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Bio::Phylo::Forest::DrawTree.3 \
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Bio::Phylo::Forest.3 \
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Bio::Phylo::Forest::Node.3 \
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Bio::Phylo::Forest::Tree.3 \
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Bio::Phylo::Generator.3 \
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Bio::Phylo::Identifiable.3 \
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Bio::Phylo::IO.3 \
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Bio::Phylo::Listable.3 \
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Bio::Phylo::Manual.3 \
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Bio::Phylo::Matrices.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datum.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Matrix.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::TypeSafeData.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Custom.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Dna.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Rna.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Restriction.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Protein.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Continuous.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Standard.3 \
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Bio::Phylo::Matrices::Datatype::Mixed.3 \
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|
Bio::Phylo::Mediators::TaxaMediator.3 \
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Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Twig.3 \
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|
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Twig.3 \
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Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document::Libxml.3 \
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Bio::Phylo::NeXML::DOM.3 \
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|
Bio::Phylo::NeXML::Meta.3 \
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|
Bio::Phylo::NeXML::Writable.3 \
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|
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Document.3 \
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|
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element::Libxml.3 \
|
|
Bio::Phylo::NeXML::DOM::Element.3 \
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Bio::Phylo::NeXML::Meta::XMLLiteral.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Abstract.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Fasta.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Newick.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Nexml.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Nexus.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Phylip.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Table.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Taxlist.3 \
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Bio::Phylo::Parsers::Tolweb.3 \
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Bio::Phylo::Project.3 \
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Bio::Phylo::Set.3 \
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Bio::Phylo::Taxa.3 \
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Bio::Phylo::Taxa::TaxaLinker.3 \
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Bio::Phylo::Taxa::Taxon.3 \
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|
Bio::Phylo::Taxa::TaxonLinker.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Abstract.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Canvas.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Gif.3 \
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Bio::Phylo::Treedrawer::Jpeg.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Pdf.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Png.3 \
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|
Bio::Phylo::Treedrawer::Swf.3 \
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Bio::Phylo::Treedrawer::Svg.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Abstract.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Mrp.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Newick.3 \
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|
Bio::Phylo::Unparsers::Nexml.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Nexus.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Pagel.3 \
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Bio::Phylo::Unparsers::Phylip.3 \
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Bio::Phylo::Util::CONSTANT.3 \
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Bio::Phylo::Util::Logger.3 \
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Bio::Phylo::Util::IDPool.3 \
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Bio::Phylo::Util::Exceptions.3 \
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Bio::Phylo::Util::StackTrace.3
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.include <bsd.port.mk>
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