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freebsd-ports
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biology
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Danilo Egea Gondolfo
23286874e3
- Move OpenMPI support to net/openmpi3. OpenMPI 1 is deprecated.
2020-04-12 09:06:25 +00:00
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abyss
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artemis
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avida
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babel
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bamtools
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bcftools
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bedtools
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biococoa
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bolt-lmm
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bowtie
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bowtie2
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bwa
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canu
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cd-hit
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cdbfasta
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checkm
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clustal-omega
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consed
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cufflinks
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cytoscape
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ddocent
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dsr-pdb
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exonerate
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fasta
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fasta3
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fastahack
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fastdnaml
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fastool
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fastp
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fastqc
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fasttree
…
fastx-toolkit
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figtree
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fluctuate
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freebayes
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garlic
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gatk
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gemma
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gff2ps
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gmap
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gperiodic
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graphlan
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grappa
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groopm
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haplohseq
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hhsuite
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hisat2
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htslib
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hyphy
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igv
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infernal
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iolib
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iqtree
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jalview
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jellyfish
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kallisto
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lagan
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lamarc
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libbigwig
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libgtextutils
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libsbml
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linux-foldingathome
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mafft
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mapm3
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minimap2
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mopac
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mothur
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mrbayes
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mummer
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muscle
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ncbi-blast+
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ncbi-toolkit
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ngs-sdk
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p5-AcePerl
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p5-Bio-ASN1-EntrezGene
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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…
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p5-BioPerl
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p5-transdecoder
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p5-TrimGalore
…
paml
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pbseqan
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pear-merger
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phrap
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phred
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phylip
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phyml
- Move OpenMPI support to net/openmpi3. OpenMPI 1 is deprecated.
2020-04-12 09:06:25 +00:00
plinkseq
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primer3
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prodigal
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prodigy-lig
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protomol
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psi88
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py-biom-format
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py-biopython
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py-bx-python
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py-cutadapt
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py-dnaio
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py-fastTSNE
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py-Genesis-PyAPI
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py-multiqc
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recombine
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rubygem-bio
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seqtools
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star
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