mirror/freebsd-ports
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Fork 0
mirror of https://git.FreeBSD.org/ports.git synced 2025-02-02 11:09:29 +00:00
Code Issues Releases Activity
freebsd-ports/biology
History
Joseph Mingrone b19510413c biology/hyphy: Bump PORTREVISION after upstream rerolled release 
Also, remove patch that upstream incorporated in new tarball.

Upstream issue: https://github.com/veg/hyphy/issues/796
2018-05-14 16:52:40 +00:00
..
ariadne
…
artemis
…
avida
…
babel
…
bamtools
…
bcftools
…
bedtools
…
biococoa
…
blat
…
bowtie
…
bowtie2
…
bwa
…
canu
…
cd-hit
…
cdbfasta
…
chemeq
…
clustalw
…
consed
…
crux
…
ddocent
…
diamond
…
emboss
…
fasta
…
fasta3
…
fastahack
…
fastdnaml
…
fastool
…
fastqc
…
fasttree
…
fastx-toolkit
…
fluctuate
…
freebayes
…
garlic
…
gff2ps
…
gmap
…
gperiodic
…
grappa
…
hmmer
…
htslib
…
hyphy
biology/hyphy: Bump PORTREVISION after upstream rerolled release
2018-05-14 16:52:40 +00:00
iolib
…
iqtree
biology/iqtree: Update to version 1.6.5
2018-05-11 16:57:09 +00:00
jalview
…
jellyfish
…
kallisto
…
lagan
…
lamarc
…
libgtextutils
…
libsbml
…
linux-foldingathome
…
mafft
…
mapm3
…
migrate
…
molden
Mark BROKEN: checksum and size mismatch
2018-05-07 05:34:10 +00:00
mopac
…
mrbayes
…
mummer
…
muscle
…
ncbi-blast+
…
ncbi-toolkit
…
njplot
…
p5-AcePerl
…
p5-Bio-ASN1-EntrezGene
…
p5-Bio-Coordinate
…
p5-Bio-Das
…
p5-Bio-Das-Lite
…
p5-Bio-FeatureIO
…
p5-Bio-GFF3
…
p5-Bio-Glite
…
p5-Bio-Graphics
…
p5-Bio-MAGETAB
…
p5-Bio-NEXUS
…
p5-Bio-Phylo
…
p5-Bio-SCF
…
p5-BioPerl
…
p5-BioPerl-Run
…
p5-transdecoder
…
p5-TrimGalore
…
paml
…
pbbam
…
pbcopper
…
pbseqan
…
pear-merger
…
phrap
…
phred
…
phylip
…
phyml
…
plink
…
plinkseq
…
primer3
…
protomol
…
psi88
…
py-biom-format
…
py-biopython
biology/py-biopython: Unbreak on python3; Add license
2018-05-13 22:30:00 +00:00
py-bx-python
…
py-cutadapt
…
py-macs2
…
py-pysam
…
pycogent
…
pyfasta
…
python-nexus
…
rainbow
…
recombine
…
ruby-bio
…
rubygem-bio
…
samtools
…
seaview
…
seqan
…
seqan1
…
seqan-apps
…
seqio
…
seqtk
…
seqtools
…
sim4
…
slclust
…
smithwaterman
…
ssaha
…
stacks
…
t_coffee
…
tabixpp
…
tinker
…
treepuzzle
…
trimadap
…
trimmomatic
…
tRNAscan-SE
…
ugene
…
unanimity
…
vcflib
…
vcftools
…
velvet
…
wise
…
xmolwt
…
Makefile
New port, biology/hyphy: Hypothesis testing using Phylogenies
2018-05-11 00:05:16 +00:00