mirror/freebsd-ports
1
0
Fork 0
mirror of https://git.FreeBSD.org/ports.git synced 2025-02-02 11:09:29 +00:00
Code Issues Releases Activity
freebsd-ports/science
History
Po-Chuan Hsieh 45e0a4924c
devel/shapelib: Update to 1.6.0 
- Add GitHub to MASTER_SITES
- Remove my LOCAL from MASTER_SITES
- Update WWW
- Update LICENSE
- Bump PORTREVISION of dependent ports for shlib change

Changes:	https://github.com/OSGeo/shapelib/releases
		http://shapelib.maptools.org/release.html
Security:	CVE-2022-0699
2023-12-26 00:10:50 +08:00
..
2d-rewriter
…
abinit
…
afni
science/afni: update to 23.3.14
2023-12-22 20:27:54 +01:00
agrum
…
aircraft-datcom
…
ALPSCore
…
antioch
…
apbs
…
arbor
…
ascent
…
atompaw
…
avogadro2
…
avogadrolibs
…
axom
…
bagel
…
bddsolve
…
berkeleygw
…
bodr
…
bout++
…
bout++-merging-filaments
…
buddy
…
cantera
devel/libfmt: Update to 10.1.1
2023-12-14 23:49:40 +08:00
cardioid
…
cdf
…
cdk
…
cdo
…
cgnslib
…
cgribex
…
checkmol
…
chemical-mime-data
…
chemicalfun
devel/libfmt: Update to 10.1.1
2023-12-14 23:49:40 +08:00
chemps2
…
chemtool
…
chemtool-devel
…
chimes-calculator
…
ChipmunkPhysics
…
chrono
…
cif-tools
science/cif-tools: update 1.0.9 → 1.0.11
2023-12-18 19:25:12 -08:00
clhep
…
clipper
…
code_saturne
science/code_saturne: upgrade to v8.1.0
2023-12-15 16:18:47 +01:00
colt
…
conduit
…
coordgenlibs
…
cp2k
…
cp2k-data
…
csvtk
…
dakota
…
dalton
…
dd_package
…
devisor
…
dftbplus
…
dftd3
…
dftd4
…
dimod
…
dirac
…
dkh
…
dlib-cpp
…
drawxtl
…
dssp
…
dvc
…
dwave-preprocessing
…
dynare
…
eccodes
…
elk
science/elk: update 9.2.5 → 9.2.12
2023-12-19 01:36:38 -08:00
elmerfem
…
epte
…
erd
…
ergo
…
erkale
…
erkale-pseudopotentials
…
fastcap
…
fasthenry
…
fastjet
…
feff10
…
fleur
…
frontistr
…
fsom
…
fvcom
…
fvcom-mpi
…
gabedit
…
gamess-us
…
gbtolib
…
gchemutils
*/*: Bump consumers of x11-toolkits/gtk30
2023-12-23 18:14:14 +00:00
gcp
…
gdma
…
geant4
…
gemmi
science/{,py-}gemmi: update 0.6.3 → 0.6.4
2023-12-14 13:04:02 -08:00
getdp
…
ghemical
science/ghemical: Fix build by fixing plist
2023-12-13 22:53:17 -08:00
ghmm
…
gnudatalanguage
devel/shapelib: Update to 1.6.0
2023-12-26 00:10:50 +08:00
gpaw-setups
…
gramps
*/*: Bump consumers of x11-toolkits/gtk30
2023-12-23 18:14:14 +00:00
grib_api
…
gromacs
…
gsmc
…
gtamsanalyzer
…
h5utils
…
h5z-zfp
…
harminv
…
hdf
…
hdf5
…
hdf5-18
…
hdf5-110
…
healpix
…
helfem
…
hepmc3
…
highfive
…
hypre
…
iboview
…
InsightToolkit
…
InsightToolkit501
…
isaac-cfd
…
jdftx
…
jmol
…
jstrack
…
kalzium
…
kim-api
…
kplib
…
kst2
…
lammps
science/lammps: update 2023.08.02 → 2023.11.21
2023-12-14 12:34:17 -08:00
lamprop
…
latte
…
libaec
science/libaec: Add make test
2023-12-25 17:03:13 +08:00
libccp4
…
libcifpp
…
libcint
…
libctl
…
libecpint
…
libefp
…
libgetar
…
libghemical
…
libgridxc
…
libint
…
libint2
science/libint2: update 2.7.2 → 2.8.1
2023-12-20 08:50:40 -08:00
libint2-psi4
…
libkml
…
liblinear
…
libmbd
…
libmsym
…
libnegf
…
liboglappth
…
libquantum
…
libssm
…
libsvm
…
libsvm-python
…
libtensorflow1
science/libtensorflow1: Mark DEPRECATED
2023-12-15 13:55:45 +01:00
libvdwxc
…
libxc
…
liggghts
…
linux-zotero
…
luscus
…
m-aneos
…
madness
…
maeparser
…
massxpert
…
mbdyn
…
mcpl
…
mcstas
…
mcstas-comps
…
mctc-lib
…
mcxtrace
…
mcxtrace-comps
…
mdynamix
science/mdynamix: update 5.2.8 → 5.3.0
2023-12-14 12:34:17 -08:00
medit
…
meep
…
mercantile
…
metaphysicl
…
minc2
…
mmdb2
…
mmtf-cpp
…
mol2ps
*/*: Bump PORTREVISION because lang/fpc installs missing serial unit
2023-12-22 20:11:51 -05:00
molgif
…
molscript
…
molsketch
…
mopac
…
mp2d
…
mpb
…
mpqc
…
mrchem
…
mrcpp
…
msms
…
mstore
…
multicharge
…
multiwfn
…
mutationpp
…
namd
…
ncrystal
…
nest
…
netcdf
…
netcdf-cxx
…
netcdf-fortran
…
nifticlib
…
nlcglib
…
nwchem
…
nwchem-data
…
ocean
…
octopus
…
openbabel
…
openems
…
openkim-models
…
openmc
devel/libfmt: Update to 10.1.1
2023-12-14 23:49:40 +08:00
openmodelica
…
openmolcas
…
openmx
…
opensim-core
…
opensph
science/opensph: update 0.4.0 → 0.4.1
2023-12-18 10:02:39 -08:00
opsin
…
orthanc
…
orthanc-dicomweb
…
orthanc-mysql
…
orthanc-postgresql
…
orthanc-webviewer
…
p5-Algorithm-SVMLight
…
p5-Chemistry-3DBuilder
…
p5-Chemistry-Bond-Find
…
p5-Chemistry-Canonicalize
…
p5-Chemistry-Elements
…
p5-Chemistry-File-MDLMol
…
p5-Chemistry-File-Mopac
…
p5-Chemistry-File-PDB
…
p5-Chemistry-File-SLN
…
p5-Chemistry-File-SMARTS
…
p5-Chemistry-File-SMILES
…
p5-Chemistry-File-VRML
…
p5-Chemistry-File-XYZ
…
p5-Chemistry-FormulaPattern
…
p5-Chemistry-InternalCoords
…
p5-Chemistry-Isotope
…
p5-Chemistry-MacroMol
…
p5-Chemistry-MidasPattern
…
p5-Chemistry-Mok
…
p5-Chemistry-Mol
…
p5-Chemistry-Pattern
…
p5-Chemistry-Reaction
…
p5-Chemistry-Ring
…
p5-Geo-BUFR
…
p5-Geo-Calc
…
p5-Geo-Coordinates-Converter
…
p5-Geo-Coordinates-Converter-iArea
…
p5-Geo-Coordinates-Transform
…
p5-Geo-WebService-Elevation-USGS
…
p5-Mcstas-Tools
…
p5-PerlMol
…
p5-Physics-Unit
…
packmol
…
pagmo2
…
paje
…
paraview
devel/protobuf: Update to 24.4
2023-12-15 01:03:10 +08:00
pastix
science/pastix: upgrade to v6.3.2
2023-12-14 19:34:00 +01:00
pcmsolver
…
PETSc
…
phonopy
…
plumed
…
pnetcdf
…
polytope
…
precice
…
psi4
…
pulseview
…
py-abipy
…
py-access
…
py-arbor
…
py-arch
…
py-asap3
…
py-asdf
…
py-asdf-standard
…
py-asdf-transform-schemas
…
py-asdf-unit-schemas
…
py-ase
…
py-atomium
…
py-avogadrolibs
…
py-boutdata
…
py-boututils
…
py-cdo
…
py-cfgrib
…
py-chainer
devel/protobuf: Update to 24.4
2023-12-15 01:03:10 +08:00
py-chainer-chemistry
…
py-chempy
…
py-cirq-aqt
…
py-cirq-core
…
py-cirq-google
…
py-cirq-ionq
…
py-cirq-pasqal
…
py-cirq-rigetti
…
py-coards
…
py-DendroPy
…
py-dftbplus
…
py-dftd4
…
py-dimod
…
py-dipy
science/py-dipy: update 1.7.0 → 1.8.0
2023-12-17 11:01:49 -08:00
py-dlib
science/py-dlib: Update to 19.24.2
2023-12-19 19:33:52 +03:00
py-dwave-cloud-client
…
py-dwave-greedy
…
py-dwave-hybrid
…
py-dwave-inspector
…
py-dwave-neal
…
py-dwave-networkx
…
py-dwave-ocean-sdk
…
py-dwave-preprocessing
…
py-dwave-samplers
…
py-dwave-system
…
py-dwave-tabu
…
py-dwavebinarycsp
…
py-earthpy
…
py-eccodes
…
py-emmet-core
…
py-esda
…
py-fresnel
…
py-gemmi
science/{,py-}gemmi: update 0.6.3 → 0.6.4
2023-12-14 13:04:02 -08:00
py-geolinks
…
py-geomet
…
py-geometer
…
py-geometric
…
py-gpaw
…
py-GPy
…
py-GPyOpt
…
py-gsd
…
py-h5json
…
py-h5py
…
py-HepMC3
…
py-hiphive
…
py-hoomd-blue
science/py-hoomd-blue: update 4.4.0 → 4.4.1
2023-12-22 00:05:38 -08:00
py-inequality
…
py-ipygany
…
py-jupyter_jsmol
…
py-kim-query
…
py-kimpy
…
py-kinematics
…
py-kliff
…
py-kpLib
…
py-liac-arff
…
py-libgetar
…
py-libpysal
…
py-lifelines
…
py-MDAnalysis
…
py-MDAnalysisTests
…
py-mdp
…
py-meshio
…
py-mmcif
…
py-mmtf-python
…
py-molmod
…
py-moltemplate
…
py-mp-api
…
py-mpcontribs-client
…
py-mrchem
…
py-ncrystal
…
py-netCDF4
…
py-netcdf-flattener
…
py-nglview
…
py-nibabel
…
py-nilearn
…
py-obspy
…
py-oddt
…
py-openbabel
…
py-OpenFermion
…
py-OpenFermion-Dirac
…
py-OpenFermion-PySCF
…
py-OpenMC
…
py-openpiv
…
py-optking
…
py-paida
…
py-paramz
…
py-penaltymodel
…
py-phono3py
…
py-phonopy
…
py-PubChemPy
…
py-pupynere
…
py-py3Dmol
…
py-pyaixi
…
py-pyberny
…
py-pycsw
…
py-pydicom
…
py-PyFR
…
py-pygeodesy
…
py-pygeometa
…
py-pygmo2
…
py-pyked
…
py-pymatgen
…
py-pymatgen-analysis-alloys
…
py-pymbd
…
py-pymol
…
py-PyNE
…
py-pyosf
…
py-pyprecice
…
py-pyqubo
…
py-pysal
…
py-pyscf
…
py-pyteomics
…
py-qcelemental
…
py-qcengine
…
py-qiskit
…
py-qiskit-aer
…
py-qiskit-dynamics
…
py-qiskit-experiments
…
py-qiskit-finance
…
py-qiskit-ibm-experiment
…
py-qiskit-ibm-provider
…
py-qiskit-ibmq-provider
…
py-qiskit-nature
…
py-qiskit-optimization
…
py-qiskit-terra
…
py-qspin
…
py-quantities
…
py-rmf
science/{,py-}rmf: update 1.5.1 → 1.6.0
2023-12-15 14:23:55 -08:00
py-rmsd
…
py-ruffus
science/py-ruffus: Update to 2.8.4
2023-12-20 11:52:13 +01:00
py-scikit-fuzzy
…
py-scikit-learn
…
py-scikit-optimize
…
py-scikit-sparse
…
py-scimath
…
py-scipy
…
py-scoria
…
py-sdf
…
py-segregation
…
py-segyio
…
py-signac
…
py-SimpleSpectral
…
py-sklearn-pandas
…
py-skrebate
…
py-spaghetti
…
py-spglib
…
py-tensorflow
devel/protobuf: Update to 24.4
2023-12-15 01:03:10 +08:00
py-thewalrus
…
py-tobler
…
py-trainstation
…
py-trx-python
science/py-trx-python: New port: Experiments with new file format for tractography
2023-12-17 11:01:48 -08:00
py-tweedledum
…
py-vedo
…
py-veusz
…
py-xbout
…
pybrain
…
pynn
…
q
…
qbox
science/qbox: update 1_76_0 → 1_76_1
2023-12-25 00:26:27 -08:00
qcl
…
qiskit-aer
devel/libfmt: Update to 10.1.1
2023-12-14 23:49:40 +08:00
qmcpack
…
qt6-quick3dphysics
…
quantum-espresso
…
quantum-espresso-pseudopotentials
…
quantum-jet
…
qwalk
…
R-cran-bayesm
…
R-cran-cmprsk
…
R-cran-DCluster
…
R-cran-e1071
…
R-cran-eco
…
R-cran-Epi
…
R-cran-epicalc
…
R-cran-etm
…
R-cran-FAdist
…
R-cran-fastICA
…
R-cran-kernlab
…
R-cran-ks
…
R-cran-snow
…
R-cran-som
…
R-cran-udunits2
…
rdkit
science/rdkit: Update/add BROKEN_xx lines
2023-12-14 15:19:48 -08:00
rmf
science/{,py-}rmf: update 1.5.1 → 1.6.0
2023-12-15 14:23:55 -08:00
rubygem-ai4r
…
rubygem-cdo
…
rubygem-rgeo
…
rubygem-rgeo-geojson
…
rubygem-rgeo-proj4
…
rubygem-rgeo-shapefile
…
rubygem-ruby-netcdf
…
salome-configuration
…
salome-kernel
…
scidavis
…
sciplot
…
segyio
…
serac
…
shelxle
…
siconos
…
siesta
science/siesta: Update WWW
2023-12-18 13:09:11 -08:00
sigrok-cli
…
sigrok-firmware
…
sigrok-firmware-fx2lafw
…
sigrok-firmware-utils
…
silo
…
simbody
…
simgrid
science/simgrid: update 3.32-20230223 → 3.35
2023-12-18 22:36:11 -08:00
simint
…
simlib
…
simple-dftd3
…
simsmith
…
sirius
…
smoldyn
…
sparta
…
spglib
…
spheral
…
step
…
svmlight
…
tblite
…
teem
…
tfel
…
tfel-edf
…
thermofun
…
tinker
…
trilinos
…
ttk
…
tweedledum
…
udunits
…
ukrmol+
…
v_sim
*/*: Bump consumers of x11-toolkits/gtk30
2023-12-23 18:14:14 +00:00
vipster
science/vipster: Not broken with libfmt-10.1.1
2023-12-22 01:13:11 -08:00
vmd
…
voro++
…
votca
…
wannier90
…
wwplot
…
wxmacmolplt
…
xcfun
…
xcrysden
…
xdrawchem
…
xtb
…
yoda
…
zotero
*/*: Bump consumers of x11-toolkits/gtk30
2023-12-23 18:14:14 +00:00
zx
…
Makefile
science/py-trx-python: New port: Experiments with new file format for tractography
2023-12-17 11:01:48 -08:00